Фьорды являются уникальным местом для подводных погружений. Загадка подводного мира фьордов заключается в том, что верхний слой воды - пресный и насыщен танином, который поглощает солнечный свет. Это приводит к тому, что соленая вода под этим слоем всегда спокойна, и там царит темнота. Такие необычные условия позволяют глубинным формам жизни развиваться на мелководье, что дает уникальный шанс дайвингистам полюбоваться губками, анемониями и рыбами, которые обычно встречаются только на глубине от 100 м. Кроме того, во фьордах сохранились древнейшие красные и черные кораллы, обитающие в нормальных условиях на глубине 45-50 м.

Самым доступным для туристов является фьорд Милфорд Саунд (Milford Sound). Фьорд Даубтфул Саунд (Doubtful Sound), находящийся дальше от Квинстауна, также популярен для посещения и подводных погружений.